Cette page contient des suggestions d’animation, sentez-vous libres d’adapter en fonction de vos envies et besoins !

Liste de thématiques

• Segmentation et analyse d’images biomédicales
• Classification
• Prédiction
• Recalage d’images
• Méthodes pour l’analyse d’images multimodales: intégration imagerie et autres données (cliniques, omiques…)
• Évaluation et validation des approches
• Modèles génératifs / synthèse d’images
• Pré-traitement
• Approches par graphes
• Acquisition et reconstruction d’images / Restauration et amélioration des images
• Approches géométriques
• Méthodes de validation
• Séries temporelles, données longitudinales
• Données manquantes / Augmentation de données

Proposition de format du temps d’échange

Voici une proposition pour les différentes étapes du temps d’échange. Chaque étape de discussions est accompagnée d’idées de questions pour vous guider, présentées à la suite.

1. Tour de table de présentation de soi, et des thématiques de recherche en notant les thèmes sur le paperboard.
2. Identification de quelques thèmes clés et choix des sujets à discuter plus en détail avec toute la table, et/ou constitution de sous-groupes en fonction des affinités ou des - expertises.
3. Discussions plus amples autour des questions liées au thème, et/ou du partage de ressources et de bonnes pratiques, et/ou sur des questions personnelles.
4. Mise en commun et préparation de la restitution.

Présentation

• Quel est votre parcours ? Sur quoi portent vos recherches ?
• Une réussite et un échec que vous acceptez de partager ?
• Qu’est-ce qui vous passionne dans votre sujet de recherche ?

Questions liées au thème

• En quoi vos travaux sont-ils liés au thème de cette table ?
• Pourquoi avez-vous choisi de venir à cette table ?
• Une frustration, une question ou un challenge actuel dans votre recherche ?
• Des pièges ou erreurs que vous auriez aimé éviter ?
• Avez-vous déjà changé d’avis sur un sujet fondamental de votre recherche ?
• Comment mettre en place des collaborations ?

Partage de ressources & bonnes pratiques

• Cours en ligne, summer schools, tutos, papiers de review, software, librairies, …
• Une ressource (papier, conférence, podcast…) qui a changé votre façon de voir votre domaine ?
• Astuces de gestion de projet ou outils collaboratifs recommandés ?
• Comment restez-vous à jour dans votre champ de recherche ?
• Quelles sont les questions clés à se poser avant de lancer un projet ?

Questions personnelles

• Combien de temps vous a-t-il fallu pour vous sentir légitime dans votre domaine ?
• Comment abordez-vous les périodes de doute ou d’incertitude ?

Clôture & mise en commun

• Une chose que vous retenez de la discussion ?
• Une idée que vous avez envie d’essayer / approfondir après la conférence ?
• Lister les collaborations ou suites possibles à cette discussion

• Niveau débutant
  • Pré-requis : aucun
  • Programme : versionnage de code avec git
• Niveau intermédiaire
  • Pré-requis : avoir utilisé git a minima pour des projets personnels
  • Programme : code collaboratif avec git

Bonnes pratiques de code - équipe Creatis - 1h

• Pré-requis : connaissances générales basiques en Deep Learning
• Programme :
  • Présentation d’un template de projet pour faciliter ses expérimentations en IA/Deep Learning
  • Présentations détaillée des librairies Hydra et Lightning

Figures scientifiques avec Inkscape - Sophie Carneiro Esteves et Celia Goujat - 30 mins

• Pré-requis : aucun
• Programme : 
  • Création d’objets (image, forme, équation) et leurs transformations
  • Gestions des objets dans l’espace ( faire plusieurs calques, alignement, …)
  • Sauvegarde des images
  • Bonnes pratiques des schémas (choix des couleurs, format …)  

Faire des présentations avec manim-slides - Robin Trombetta - 30 mins

• Pré-requis : aucun
• Programme :
  • Présentation des librairies Manim et Manim-slides
  • Démonstration d’une animation pour illustrer un concept de Deep Learning
  • Création guidée d’une première animation
  • Discussion des cas d’usages, avantages et limites des librairies

Confection du site web IABM (Git & HTML/CSS) - Thibault de Varax - 1h

• Pré-requis: Git (savoir faire une PR), écrire un markdown (mais bon, prise en main très facile)
• Programme :
  • Ajouter les laboratoires du réseau à l’annuaire
  • Écrire les pages statiques du site (accueil, description du réseau, etc.)
  • Ajout des articles de restitution des discussions de la matinée

Retour d’expérience post doc - Reuben Dorent - 30 mins

• Postdoctoral Marie Curie fellowship
• Postdoc à l’étranger

Le site est déployé grâce au dépôt GitHub dédié. Pour encourager la contribution à ce site, le choix a été fait d’écrire le contenu de celui-ci dans des fichiers Markdown, dont la syntaxe est simple à prendre en main. Il est donc a priori facile, même pour des utilisateurs non initiés au développement web, d’ajouter du contenu ou de suggérer des modifications.

Quelques pistes pour contribuer:

• ajouter votre laboratoire à l’annuaire;
• publier du contenu via des articles (comme par exemple vos derniers résultats de recherche);
• compléter les pages statiques du site (page d’accueil, description du réseau, etc.).

Pour ce faire, veuillez suivre les instructions de la page d’accueil du dépôt Git.

View the markdown used to create this post.

Basics

This is a paragraph, it’s surrounded by whitespace.

Use two trailing spaces
on the right
to create linebreak tags

Next up are some headers:

A subtitle

Header level 3

Lists

• A bulletted list
  • an indented list item
• Second element
  I need to add another paragraph below the second list item.
• A third element.

1. An
2. ordered
3. list

Markup styles

• italics or italics
• bold
• code()
• strikethrough

Code

for k in range(10):
    print('hello world!')

Quotes

Blockquote

Nested Blockquote

Quotes and other elements

• item A.
• item B.

Everything works as expected.

Footnotes

Here’s a simple footnote¹, and here’s a longer one².

Tables

• :- means the column is left aligned.
• -: means the column is right aligned.
• :-: means the column is center aligned.

Vertical bars don’t need to be aligned in markdown. Besides, you can also format text in your tables:

Horizontal lines

Links

A link to an external website.
An email: fake@example.com.
A reference to a section.
You can also emphasis a reference (here with italics).
You can change the label used to refer to a section.
And a reference to another page of the website.

You can also use reference-style links: here is an example.

You can use links to make a table of contents:

1. Basics
   1. Lists
   2. Markup styles
   3. Code
   4. Quotes
   5. Footnotes
   6. Tables
   7. Horizontal lines
   8. Links
   9. Images
   10. Escaping special characters
2. Advanced
   1. Underline
   2. Indent
   3. Center
   4. Color
   5. Image size and caption

Images

An image, located within docs/images:

Escaping special characters

* Without the backslash, this would be a bullet in an unordered list.

Advanced

There are some useful things that Markdown doesn’t support. Here are some workarounds:

Underline

This text is underlined.

Indent

        Every “&nbsp” is replaced by a white space.

This can also be used to jump

two lines.

Center

Color

Image size and caption